Protein–RNA interactions for Protein: P01601

IGKV1D-16, Immunoglobulin kappa variable 1D-16 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-16P01601 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGKV1D-16P01601 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV1D-16P01601 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV1D-16P01601 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms