Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IGKV1-17P01599 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGKV1-17P01599 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGKV1-17P01599 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IGKV1-17P01599 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IGKV1-17P01599 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
IGKV1-17P01599 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms