Protein–RNA interactions for Protein: P01133

EGF, Pro-epidermal growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFP01133 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFP01133 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EGFP01133 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EGFP01133 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EGFP01133 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EGFP01133 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EGFP01133 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFP01133 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFP01133 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFP01133 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFP01133 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFP01133 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFP01133 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFP01133 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFP01133 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFP01133 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFP01133 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFP01133 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFP01133 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFP01133 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EGFP01133 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFP01133 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFP01133 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFP01133 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFP01133 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFP01133 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFP01133 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFP01133 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFP01133 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EGFP01133 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFP01133 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EGFP01133 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFP01133 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFP01133 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFP01133 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFP01133 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EGFP01133 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EGFP01133 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EGFP01133 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EGFP01133 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EGFP01133 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EGFP01133 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EGFP01133 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFP01133 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFP01133 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFP01133 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFP01133 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFP01133 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFP01133 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFP01133 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EGFP01133 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EGFP01133 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EGFP01133 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EGFP01133 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFP01133 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFP01133 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFP01133 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFP01133 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFP01133 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFP01133 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFP01133 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFP01133 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFP01133 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFP01133 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFP01133 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFP01133 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFP01133 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFP01133 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFP01133 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFP01133 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFP01133 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFP01133 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFP01133 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFP01133 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFP01133 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFP01133 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFP01133 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFP01133 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFP01133 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFP01133 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFP01133 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFP01133 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFP01133 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFP01133 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFP01133 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFP01133 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFP01133 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFP01133 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EGFP01133 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFP01133 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFP01133 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EGFP01133 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFP01133 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFP01133 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFP01133 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFP01133 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFP01133 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EGFP01133 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFP01133 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EGFP01133 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.6 ms