Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F13A1P00488 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F13A1P00488 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
F13A1P00488 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
F13A1P00488 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
F13A1P00488 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
F13A1P00488 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
F13A1P00488 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
F13A1P00488 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
F13A1P00488 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
F13A1P00488 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
F13A1P00488 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
F13A1P00488 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
F13A1P00488 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
F13A1P00488 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
F13A1P00488 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
F13A1P00488 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
F13A1P00488 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
F13A1P00488 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
F13A1P00488 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
F13A1P00488 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
F13A1P00488 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
F13A1P00488 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
F13A1P00488 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
F13A1P00488 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
F13A1P00488 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
F13A1P00488 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
F13A1P00488 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
F13A1P00488 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
F13A1P00488 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
F13A1P00488 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
F13A1P00488 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
F13A1P00488 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
F13A1P00488 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
F13A1P00488 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
F13A1P00488 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
F13A1P00488 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
F13A1P00488 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
F13A1P00488 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
F13A1P00488 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
F13A1P00488 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
F13A1P00488 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
F13A1P00488 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
F13A1P00488 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
F13A1P00488 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
F13A1P00488 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
F13A1P00488 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
F13A1P00488 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
F13A1P00488 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
F13A1P00488 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
F13A1P00488 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
F13A1P00488 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
F13A1P00488 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
F13A1P00488 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
F13A1P00488 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
F13A1P00488 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
F13A1P00488 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
F13A1P00488 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
F13A1P00488 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
F13A1P00488 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
F13A1P00488 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
F13A1P00488 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
F13A1P00488 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
F13A1P00488 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
F13A1P00488 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
F13A1P00488 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
F13A1P00488 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
F13A1P00488 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
F13A1P00488 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
F13A1P00488 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
F13A1P00488 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
F13A1P00488 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
F13A1P00488 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
F13A1P00488 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
F13A1P00488 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
F13A1P00488 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
F13A1P00488 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
F13A1P00488 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
F13A1P00488 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
F13A1P00488 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
F13A1P00488 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
F13A1P00488 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
F13A1P00488 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
F13A1P00488 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
F13A1P00488 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
F13A1P00488 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
F13A1P00488 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
F13A1P00488 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
F13A1P00488 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
F13A1P00488 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
F13A1P00488 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
F13A1P00488 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
F13A1P00488 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
F13A1P00488 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
F13A1P00488 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
F13A1P00488 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
F13A1P00488 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
F13A1P00488 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
F13A1P00488 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
F13A1P00488 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms