Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTCP00480 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTCP00480 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
OTCP00480 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTCP00480 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTCP00480 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTCP00480 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTCP00480 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTCP00480 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTCP00480 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTCP00480 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
OTCP00480 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTCP00480 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTCP00480 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTCP00480 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTCP00480 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTCP00480 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTCP00480 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTCP00480 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTCP00480 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTCP00480 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTCP00480 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTCP00480 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTCP00480 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTCP00480 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTCP00480 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTCP00480 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTCP00480 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTCP00480 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OTCP00480 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTCP00480 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTCP00480 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OTCP00480 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTCP00480 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTCP00480 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OTCP00480 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTCP00480 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTCP00480 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTCP00480 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTCP00480 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTCP00480 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTCP00480 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
OTCP00480 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTCP00480 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTCP00480 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTCP00480 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTCP00480 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTCP00480 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OTCP00480 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTCP00480 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTCP00480 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTCP00480 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTCP00480 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTCP00480 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTCP00480 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
OTCP00480 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTCP00480 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTCP00480 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTCP00480 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTCP00480 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTCP00480 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTCP00480 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTCP00480 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTCP00480 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTCP00480 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTCP00480 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTCP00480 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTCP00480 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTCP00480 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTCP00480 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
OTCP00480 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTCP00480 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTCP00480 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTCP00480 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTCP00480 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTCP00480 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTCP00480 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTCP00480 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTCP00480 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTCP00480 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTCP00480 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTCP00480 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OTCP00480 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTCP00480 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTCP00480 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTCP00480 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTCP00480 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OTCP00480 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTCP00480 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTCP00480 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTCP00480 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTCP00480 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTCP00480 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTCP00480 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTCP00480 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTCP00480 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTCP00480 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTCP00480 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTCP00480 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTCP00480 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms