Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NSD2O96028 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NSD2O96028 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NSD2O96028 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NSD2O96028 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NSD2O96028 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NSD2O96028 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NSD2O96028 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NSD2O96028 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NSD2O96028 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NSD2O96028 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NSD2O96028 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
NSD2O96028 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NSD2O96028 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NSD2O96028 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NSD2O96028 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NSD2O96028 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NSD2O96028 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NSD2O96028 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
NSD2O96028 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NSD2O96028 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NSD2O96028 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NSD2O96028 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NSD2O96028 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NSD2O96028 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
NSD2O96028 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NSD2O96028 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NSD2O96028 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NSD2O96028 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NSD2O96028 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NSD2O96028 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
NSD2O96028 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NSD2O96028 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
NSD2O96028 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NSD2O96028 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NSD2O96028 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NSD2O96028 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NSD2O96028 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NSD2O96028 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NSD2O96028 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
NSD2O96028 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NSD2O96028 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NSD2O96028 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NSD2O96028 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NSD2O96028 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NSD2O96028 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NSD2O96028 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
NSD2O96028 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
NSD2O96028 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NSD2O96028 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NSD2O96028 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NSD2O96028 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NSD2O96028 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NSD2O96028 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NSD2O96028 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NSD2O96028 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
NSD2O96028 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NSD2O96028 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NSD2O96028 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NSD2O96028 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NSD2O96028 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NSD2O96028 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NSD2O96028 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NSD2O96028 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NSD2O96028 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NSD2O96028 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
NSD2O96028 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NSD2O96028 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NSD2O96028 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NSD2O96028 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NSD2O96028 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NSD2O96028 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NSD2O96028 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NSD2O96028 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NSD2O96028 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NSD2O96028 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
NSD2O96028 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NSD2O96028 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NSD2O96028 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NSD2O96028 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NSD2O96028 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NSD2O96028 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NSD2O96028 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NSD2O96028 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NSD2O96028 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NSD2O96028 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NSD2O96028 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NSD2O96028 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NSD2O96028 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NSD2O96028 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NSD2O96028 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NSD2O96028 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NSD2O96028 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NSD2O96028 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NSD2O96028 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NSD2O96028 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NSD2O96028 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NSD2O96028 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NSD2O96028 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NSD2O96028 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms