Protein–RNA interactions for Protein: O96005

CLPTM1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1O96005 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLPTM1O96005 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLPTM1O96005 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLPTM1O96005 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms