Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST3O95803 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST3O95803 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST3O95803 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST3O95803 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDST3O95803 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST3O95803 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST3O95803 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST3O95803 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST3O95803 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDST3O95803 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST3O95803 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST3O95803 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST3O95803 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST3O95803 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST3O95803 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST3O95803 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDST3O95803 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST3O95803 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST3O95803 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST3O95803 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST3O95803 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDST3O95803 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NDST3O95803 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDST3O95803 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDST3O95803 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDST3O95803 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NDST3O95803 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDST3O95803 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDST3O95803 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST3O95803 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST3O95803 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST3O95803 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDST3O95803 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST3O95803 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST3O95803 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST3O95803 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST3O95803 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST3O95803 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST3O95803 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDST3O95803 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDST3O95803 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDST3O95803 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDST3O95803 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDST3O95803 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDST3O95803 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDST3O95803 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDST3O95803 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDST3O95803 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST3O95803 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST3O95803 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST3O95803 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST3O95803 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST3O95803 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST3O95803 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST3O95803 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDST3O95803 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST3O95803 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST3O95803 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST3O95803 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST3O95803 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST3O95803 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST3O95803 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST3O95803 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDST3O95803 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST3O95803 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST3O95803 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST3O95803 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST3O95803 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDST3O95803 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST3O95803 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST3O95803 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST3O95803 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST3O95803 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST3O95803 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST3O95803 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST3O95803 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST3O95803 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST3O95803 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NDST3O95803 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST3O95803 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST3O95803 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDST3O95803 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST3O95803 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST3O95803 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST3O95803 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDST3O95803 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST3O95803 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST3O95803 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST3O95803 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST3O95803 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST3O95803 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST3O95803 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST3O95803 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDST3O95803 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST3O95803 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST3O95803 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST3O95803 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST3O95803 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST3O95803 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms