Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF1O95521 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAMEF1O95521 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF1O95521 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms