Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM63AO94886 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM63AO94886 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM63AO94886 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms