Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK2AP2O75956 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK2AP2O75956 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms