Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FLOT1O75955 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FLOT1O75955 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FLOT1O75955 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FLOT1O75955 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms