Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCM2O75603 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM2O75603 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM2O75603 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM2O75603 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM2O75603 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM2O75603 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM2O75603 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM2O75603 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM2O75603 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCM2O75603 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCM2O75603 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCM2O75603 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCM2O75603 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCM2O75603 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCM2O75603 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCM2O75603 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCM2O75603 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCM2O75603 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCM2O75603 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCM2O75603 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCM2O75603 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCM2O75603 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCM2O75603 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCM2O75603 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCM2O75603 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCM2O75603 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCM2O75603 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCM2O75603 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCM2O75603 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCM2O75603 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCM2O75603 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCM2O75603 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCM2O75603 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCM2O75603 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCM2O75603 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCM2O75603 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCM2O75603 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCM2O75603 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCM2O75603 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCM2O75603 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCM2O75603 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCM2O75603 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GCM2O75603 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCM2O75603 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCM2O75603 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GCM2O75603 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCM2O75603 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCM2O75603 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCM2O75603 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCM2O75603 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCM2O75603 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCM2O75603 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCM2O75603 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCM2O75603 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCM2O75603 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCM2O75603 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCM2O75603 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GCM2O75603 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCM2O75603 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCM2O75603 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCM2O75603 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCM2O75603 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCM2O75603 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCM2O75603 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCM2O75603 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCM2O75603 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCM2O75603 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCM2O75603 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCM2O75603 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCM2O75603 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCM2O75603 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCM2O75603 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCM2O75603 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCM2O75603 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCM2O75603 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCM2O75603 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCM2O75603 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCM2O75603 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCM2O75603 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCM2O75603 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCM2O75603 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCM2O75603 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCM2O75603 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCM2O75603 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCM2O75603 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCM2O75603 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms