Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCATO75600 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCATO75600 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCATO75600 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCATO75600 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCATO75600 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCATO75600 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCATO75600 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCATO75600 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCATO75600 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCATO75600 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GCATO75600 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCATO75600 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCATO75600 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCATO75600 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCATO75600 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCATO75600 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCATO75600 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GCATO75600 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCATO75600 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCATO75600 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCATO75600 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCATO75600 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GCATO75600 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCATO75600 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCATO75600 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCATO75600 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCATO75600 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCATO75600 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCATO75600 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCATO75600 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCATO75600 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCATO75600 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCATO75600 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCATO75600 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GCATO75600 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCATO75600 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCATO75600 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCATO75600 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCATO75600 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCATO75600 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCATO75600 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCATO75600 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCATO75600 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCATO75600 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCATO75600 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCATO75600 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GCATO75600 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCATO75600 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCATO75600 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCATO75600 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCATO75600 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCATO75600 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCATO75600 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCATO75600 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCATO75600 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCATO75600 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCATO75600 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCATO75600 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCATO75600 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCATO75600 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCATO75600 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCATO75600 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCATO75600 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCATO75600 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCATO75600 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCATO75600 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCATO75600 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCATO75600 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GCATO75600 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCATO75600 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCATO75600 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCATO75600 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCATO75600 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GCATO75600 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCATO75600 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCATO75600 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GCATO75600 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCATO75600 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCATO75600 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCATO75600 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCATO75600 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCATO75600 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCATO75600 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCATO75600 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCATO75600 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCATO75600 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCATO75600 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCATO75600 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCATO75600 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCATO75600 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCATO75600 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCATO75600 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GCATO75600 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCATO75600 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCATO75600 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCATO75600 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GCATO75600 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GCATO75600 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GCATO75600 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms