Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E2F6O75461 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F6O75461 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F6O75461 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F6O75461 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F6O75461 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F6O75461 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F6O75461 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F6O75461 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F6O75461 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E2F6O75461 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F6O75461 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F6O75461 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F6O75461 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F6O75461 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F6O75461 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F6O75461 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F6O75461 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F6O75461 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F6O75461 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F6O75461 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F6O75461 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
E2F6O75461 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F6O75461 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F6O75461 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F6O75461 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F6O75461 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
E2F6O75461 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F6O75461 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F6O75461 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F6O75461 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
E2F6O75461 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F6O75461 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F6O75461 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F6O75461 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F6O75461 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F6O75461 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F6O75461 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F6O75461 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F6O75461 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
E2F6O75461 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
E2F6O75461 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F6O75461 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F6O75461 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
E2F6O75461 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F6O75461 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F6O75461 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F6O75461 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F6O75461 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F6O75461 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
E2F6O75461 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F6O75461 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F6O75461 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F6O75461 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F6O75461 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F6O75461 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F6O75461 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F6O75461 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F6O75461 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F6O75461 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F6O75461 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F6O75461 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F6O75461 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F6O75461 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F6O75461 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F6O75461 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F6O75461 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F6O75461 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F6O75461 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F6O75461 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F6O75461 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F6O75461 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F6O75461 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F6O75461 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F6O75461 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F6O75461 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F6O75461 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F6O75461 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F6O75461 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F6O75461 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F6O75461 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F6O75461 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F6O75461 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F6O75461 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F6O75461 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F6O75461 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F6O75461 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F6O75461 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F6O75461 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F6O75461 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F6O75461 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F6O75461 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F6O75461 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F6O75461 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F6O75461 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F6O75461 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F6O75461 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F6O75461 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F6O75461 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F6O75461 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms