Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMPCBO75439 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMPCBO75439 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMPCBO75439 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMPCBO75439 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PMPCBO75439 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PMPCBO75439 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PMPCBO75439 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PMPCBO75439 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PMPCBO75439 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMPCBO75439 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMPCBO75439 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms