Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIA4O75335 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA4O75335 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA4O75335 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PPFIA4O75335 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms