Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP12O75317 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP12O75317 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP12O75317 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP12O75317 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP12O75317 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP12O75317 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP12O75317 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP12O75317 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP12O75317 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP12O75317 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP12O75317 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP12O75317 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP12O75317 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP12O75317 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP12O75317 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP12O75317 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP12O75317 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP12O75317 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP12O75317 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP12O75317 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP12O75317 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP12O75317 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP12O75317 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP12O75317 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP12O75317 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP12O75317 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP12O75317 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP12O75317 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP12O75317 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP12O75317 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP12O75317 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP12O75317 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP12O75317 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP12O75317 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP12O75317 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP12O75317 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP12O75317 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP12O75317 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP12O75317 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP12O75317 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP12O75317 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP12O75317 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP12O75317 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP12O75317 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP12O75317 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP12O75317 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP12O75317 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP12O75317 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP12O75317 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP12O75317 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP12O75317 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP12O75317 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP12O75317 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP12O75317 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP12O75317 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP12O75317 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP12O75317 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP12O75317 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP12O75317 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP12O75317 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP12O75317 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP12O75317 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP12O75317 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP12O75317 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP12O75317 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP12O75317 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP12O75317 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP12O75317 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP12O75317 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP12O75317 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP12O75317 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP12O75317 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP12O75317 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP12O75317 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP12O75317 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP12O75317 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP12O75317 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP12O75317 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP12O75317 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP12O75317 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP12O75317 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP12O75317 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP12O75317 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP12O75317 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP12O75317 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP12O75317 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP12O75317 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP12O75317 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP12O75317 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP12O75317 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP12O75317 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP12O75317 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP12O75317 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP12O75317 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP12O75317 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP12O75317 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP12O75317 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP12O75317 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP12O75317 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms