Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIN3BO75182 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIN3BO75182 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIN3BO75182 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIN3BO75182 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms