Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF10O60809 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF10O60809 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF10O60809 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms