Protein–RNA interactions for Protein: O60779

SLC19A2, Thiamine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A2O60779 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC19A2O60779 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC19A2O60779 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC19A2O60779 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms