Protein–RNA interactions for Protein: O60603

TLR2, Toll-like receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR2O60603 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TLR2O60603 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TLR2O60603 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR2O60603 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR2O60603 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR2O60603 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR2O60603 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR2O60603 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TLR2O60603 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TLR2O60603 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TLR2O60603 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TLR2O60603 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TLR2O60603 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TLR2O60603 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TLR2O60603 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TLR2O60603 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TLR2O60603 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR2O60603 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR2O60603 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR2O60603 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR2O60603 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TLR2O60603 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TLR2O60603 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TLR2O60603 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TLR2O60603 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TLR2O60603 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TLR2O60603 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TLR2O60603 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TLR2O60603 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TLR2O60603 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TLR2O60603 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TLR2O60603 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TLR2O60603 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TLR2O60603 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TLR2O60603 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TLR2O60603 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TLR2O60603 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TLR2O60603 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TLR2O60603 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TLR2O60603 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TLR2O60603 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TLR2O60603 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TLR2O60603 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TLR2O60603 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TLR2O60603 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TLR2O60603 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TLR2O60603 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TLR2O60603 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TLR2O60603 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TLR2O60603 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR2O60603 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR2O60603 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR2O60603 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR2O60603 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR2O60603 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR2O60603 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR2O60603 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TLR2O60603 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TLR2O60603 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TLR2O60603 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TLR2O60603 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TLR2O60603 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TLR2O60603 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TLR2O60603 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR2O60603 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR2O60603 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR2O60603 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR2O60603 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR2O60603 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR2O60603 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR2O60603 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR2O60603 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TLR2O60603 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TLR2O60603 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TLR2O60603 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR2O60603 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR2O60603 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TLR2O60603 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR2O60603 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR2O60603 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR2O60603 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR2O60603 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR2O60603 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR2O60603 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR2O60603 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR2O60603 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR2O60603 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TLR2O60603 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TLR2O60603 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TLR2O60603 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TLR2O60603 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TLR2O60603 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TLR2O60603 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TLR2O60603 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TLR2O60603 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TLR2O60603 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TLR2O60603 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TLR2O60603 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TLR2O60603 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TLR2O60603 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms