Protein–RNA interactions for Protein: O60583

CCNT2, Cyclin-T2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT2O60583 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNT2O60583 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNT2O60583 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNT2O60583 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms