Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIREO43918 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIREO43918 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIREO43918 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIREO43918 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIREO43918 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIREO43918 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIREO43918 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIREO43918 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIREO43918 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIREO43918 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIREO43918 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIREO43918 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIREO43918 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AIREO43918 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIREO43918 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIREO43918 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIREO43918 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIREO43918 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIREO43918 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIREO43918 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIREO43918 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIREO43918 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIREO43918 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIREO43918 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIREO43918 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIREO43918 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIREO43918 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIREO43918 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIREO43918 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIREO43918 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIREO43918 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIREO43918 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIREO43918 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIREO43918 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AIREO43918 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIREO43918 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AIREO43918 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIREO43918 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIREO43918 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AIREO43918 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AIREO43918 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AIREO43918 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIREO43918 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIREO43918 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIREO43918 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIREO43918 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIREO43918 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AIREO43918 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIREO43918 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIREO43918 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AIREO43918 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIREO43918 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIREO43918 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIREO43918 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIREO43918 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIREO43918 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIREO43918 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIREO43918 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIREO43918 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIREO43918 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AIREO43918 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIREO43918 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIREO43918 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIREO43918 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIREO43918 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIREO43918 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIREO43918 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIREO43918 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIREO43918 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIREO43918 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AIREO43918 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIREO43918 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIREO43918 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIREO43918 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIREO43918 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIREO43918 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIREO43918 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIREO43918 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIREO43918 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AIREO43918 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIREO43918 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIREO43918 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIREO43918 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIREO43918 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIREO43918 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIREO43918 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIREO43918 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIREO43918 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIREO43918 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIREO43918 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AIREO43918 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIREO43918 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIREO43918 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIREO43918 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIREO43918 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIREO43918 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIREO43918 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIREO43918 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AIREO43918 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms