Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EXTL3O43909 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EXTL3O43909 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXTL3O43909 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXTL3O43909 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms