Protein–RNA interactions for Protein: O43548

TGM5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM5O43548 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGM5O43548 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGM5O43548 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGM5O43548 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGM5O43548 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGM5O43548 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM5O43548 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM5O43548 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM5O43548 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM5O43548 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM5O43548 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM5O43548 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGM5O43548 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGM5O43548 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGM5O43548 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGM5O43548 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGM5O43548 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TGM5O43548 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGM5O43548 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGM5O43548 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGM5O43548 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGM5O43548 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGM5O43548 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGM5O43548 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGM5O43548 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGM5O43548 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGM5O43548 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TGM5O43548 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGM5O43548 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGM5O43548 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGM5O43548 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGM5O43548 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TGM5O43548 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TGM5O43548 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TGM5O43548 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGM5O43548 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGM5O43548 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGM5O43548 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGM5O43548 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TGM5O43548 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TGM5O43548 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TGM5O43548 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TGM5O43548 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TGM5O43548 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TGM5O43548 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TGM5O43548 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TGM5O43548 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TGM5O43548 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TGM5O43548 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TGM5O43548 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TGM5O43548 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TGM5O43548 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TGM5O43548 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TGM5O43548 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TGM5O43548 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TGM5O43548 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TGM5O43548 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TGM5O43548 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TGM5O43548 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TGM5O43548 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TGM5O43548 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TGM5O43548 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TGM5O43548 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TGM5O43548 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TGM5O43548 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TGM5O43548 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TGM5O43548 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TGM5O43548 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TGM5O43548 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TGM5O43548 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TGM5O43548 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TGM5O43548 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TGM5O43548 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TGM5O43548 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGM5O43548 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGM5O43548 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGM5O43548 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGM5O43548 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGM5O43548 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGM5O43548 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGM5O43548 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TGM5O43548 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TGM5O43548 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TGM5O43548 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TGM5O43548 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGM5O43548 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGM5O43548 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGM5O43548 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGM5O43548 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGM5O43548 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGM5O43548 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGM5O43548 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TGM5O43548 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TGM5O43548 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TGM5O43548 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TGM5O43548 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TGM5O43548 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TGM5O43548 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TGM5O43548 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGM5O43548 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms