Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF3O43395 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF3O43395 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF3O43395 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRPF3O43395 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms