Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXA2O43364 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXA2O43364 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA2O43364 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms