Protein–RNA interactions for Protein: O43182

ARHGAP6, Rho GTPase-activating protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP6O43182 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGAP6O43182 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGAP6O43182 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARHGAP6O43182 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGAP6O43182 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGAP6O43182 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGAP6O43182 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARHGAP6O43182 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ARHGAP6O43182 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARHGAP6O43182 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARHGAP6O43182 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGAP6O43182 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms