Protein–RNA interactions for Protein: O15440

ABCC5, Multidrug resistance-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC5O15440 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC5O15440 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC5O15440 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC5O15440 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC5O15440 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC5O15440 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC5O15440 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC5O15440 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC5O15440 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
ABCC5O15440 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
ABCC5O15440 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCC5O15440 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC5O15440 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC5O15440 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms