Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARPC1BO15143 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARPC1BO15143 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARPC1BO15143 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms