Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNPHO15079 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNPHO15079 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNPHO15079 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNPHO15079 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNPHO15079 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNPHO15079 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNPHO15079 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNPHO15079 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNPHO15079 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNPHO15079 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNPHO15079 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNPHO15079 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNPHO15079 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNPHO15079 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNPHO15079 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SNPHO15079 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNPHO15079 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNPHO15079 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNPHO15079 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNPHO15079 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNPHO15079 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNPHO15079 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNPHO15079 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNPHO15079 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNPHO15079 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNPHO15079 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNPHO15079 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNPHO15079 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNPHO15079 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNPHO15079 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNPHO15079 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNPHO15079 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNPHO15079 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNPHO15079 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNPHO15079 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNPHO15079 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNPHO15079 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNPHO15079 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNPHO15079 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNPHO15079 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNPHO15079 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNPHO15079 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNPHO15079 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNPHO15079 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNPHO15079 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNPHO15079 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNPHO15079 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNPHO15079 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNPHO15079 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNPHO15079 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNPHO15079 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNPHO15079 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNPHO15079 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNPHO15079 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNPHO15079 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNPHO15079 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNPHO15079 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNPHO15079 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNPHO15079 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNPHO15079 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNPHO15079 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNPHO15079 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNPHO15079 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNPHO15079 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNPHO15079 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SNPHO15079 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNPHO15079 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNPHO15079 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNPHO15079 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNPHO15079 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNPHO15079 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNPHO15079 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNPHO15079 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNPHO15079 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNPHO15079 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNPHO15079 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNPHO15079 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNPHO15079 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNPHO15079 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNPHO15079 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNPHO15079 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNPHO15079 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNPHO15079 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNPHO15079 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNPHO15079 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNPHO15079 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNPHO15079 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNPHO15079 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNPHO15079 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNPHO15079 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNPHO15079 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNPHO15079 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNPHO15079 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNPHO15079 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNPHO15079 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNPHO15079 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNPHO15079 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNPHO15079 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNPHO15079 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms