Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASKO14936 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASKO14936 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASKO14936 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASKO14936 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASKO14936 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASKO14936 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASKO14936 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASKO14936 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASKO14936 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASKO14936 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASKO14936 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASKO14936 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASKO14936 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASKO14936 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CASKO14936 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASKO14936 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASKO14936 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASKO14936 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASKO14936 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASKO14936 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASKO14936 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASKO14936 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASKO14936 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASKO14936 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASKO14936 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASKO14936 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASKO14936 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASKO14936 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CASKO14936 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASKO14936 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASKO14936 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CASKO14936 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASKO14936 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASKO14936 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASKO14936 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASKO14936 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASKO14936 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASKO14936 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASKO14936 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASKO14936 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASKO14936 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASKO14936 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASKO14936 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASKO14936 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASKO14936 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASKO14936 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASKO14936 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASKO14936 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CASKO14936 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASKO14936 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASKO14936 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CASKO14936 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASKO14936 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASKO14936 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASKO14936 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CASKO14936 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CASKO14936 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASKO14936 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASKO14936 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASKO14936 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASKO14936 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASKO14936 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASKO14936 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CASKO14936 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASKO14936 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASKO14936 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASKO14936 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASKO14936 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASKO14936 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASKO14936 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CASKO14936 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASKO14936 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASKO14936 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASKO14936 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASKO14936 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASKO14936 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASKO14936 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASKO14936 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASKO14936 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASKO14936 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASKO14936 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASKO14936 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASKO14936 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CASKO14936 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASKO14936 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASKO14936 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASKO14936 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASKO14936 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASKO14936 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASKO14936 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASKO14936 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASKO14936 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASKO14936 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASKO14936 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASKO14936 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASKO14936 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CASKO14936 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CASKO14936 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASKO14936 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms