Protein–RNA interactions for Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
CHD1O14646 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
CHD1O14646 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CHD1O14646 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CHD1O14646 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CHD1O14646 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CHD1O14646 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC40.13■■■■■ 4.02
CHD1O14646 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CHD1O14646 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CHD1O14646 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
CHD1O14646 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CHD1O14646 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CHD1O14646 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CHD1O14646 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CHD1O14646 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CHD1O14646 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CHD1O14646 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CHD1O14646 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CHD1O14646 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CHD1O14646 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CHD1O14646 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
CHD1O14646 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC40.06■■■■■ 4
CHD1O14646 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
CHD1O14646 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
CHD1O14646 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CHD1O14646 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CHD1O14646 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
CHD1O14646 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC40.03■■■■■ 4
CHD1O14646 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
CHD1O14646 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CHD1O14646 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
CHD1O14646 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
CHD1O14646 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
CHD1O14646 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
CHD1O14646 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CHD1O14646 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CHD1O14646 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
CHD1O14646 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
CHD1O14646 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
CHD1O14646 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
CHD1O14646 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CHD1O14646 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CHD1O14646 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CHD1O14646 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHD1O14646 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHD1O14646 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHD1O14646 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHD1O14646 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHD1O14646 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHD1O14646 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CHD1O14646 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CHD1O14646 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CHD1O14646 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
CHD1O14646 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CHD1O14646 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CHD1O14646 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CHD1O14646 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CHD1O14646 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CHD1O14646 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CHD1O14646 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CHD1O14646 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CHD1O14646 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CHD1O14646 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CHD1O14646 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CHD1O14646 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CHD1O14646 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CHD1O14646 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.99
CHD1O14646 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CHD1O14646 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CHD1O14646 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CHD1O14646 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CHD1O14646 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
CHD1O14646 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CHD1O14646 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CHD1O14646 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CHD1O14646 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CHD1O14646 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CHD1O14646 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CHD1O14646 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CHD1O14646 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CHD1O14646 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CHD1O14646 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CHD1O14646 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CHD1O14646 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC39.88■■■■□ 3.98
CHD1O14646 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
CHD1O14646 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CHD1O14646 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CHD1O14646 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CHD1O14646 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CHD1O14646 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CHD1O14646 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CHD1O14646 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CHD1O14646 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CHD1O14646 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CHD1O14646 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CHD1O14646 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
CHD1O14646 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CHD1O14646 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
CHD1O14646 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
CHD1O14646 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms