Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL22O00626 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL22O00626 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL22O00626 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL22O00626 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL22O00626 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL22O00626 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL22O00626 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL22O00626 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL22O00626 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL22O00626 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL22O00626 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL22O00626 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL22O00626 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL22O00626 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL22O00626 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL22O00626 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL22O00626 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL22O00626 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL22O00626 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL22O00626 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL22O00626 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL22O00626 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCL22O00626 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCL22O00626 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCL22O00626 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCL22O00626 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCL22O00626 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL22O00626 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL22O00626 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL22O00626 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL22O00626 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCL22O00626 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL22O00626 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL22O00626 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL22O00626 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL22O00626 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCL22O00626 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL22O00626 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL22O00626 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCL22O00626 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL22O00626 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL22O00626 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL22O00626 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCL22O00626 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL22O00626 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL22O00626 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL22O00626 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL22O00626 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL22O00626 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCL22O00626 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL22O00626 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL22O00626 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL22O00626 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL22O00626 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL22O00626 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL22O00626 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL22O00626 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL22O00626 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCL22O00626 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL22O00626 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL22O00626 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL22O00626 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL22O00626 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL22O00626 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL22O00626 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCL22O00626 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL22O00626 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL22O00626 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCL22O00626 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCL22O00626 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL22O00626 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL22O00626 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL22O00626 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL22O00626 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCL22O00626 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL22O00626 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL22O00626 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL22O00626 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL22O00626 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL22O00626 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL22O00626 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCL22O00626 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL22O00626 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCL22O00626 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL22O00626 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL22O00626 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL22O00626 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL22O00626 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL22O00626 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL22O00626 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL22O00626 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL22O00626 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCL22O00626 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCL22O00626 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL22O00626 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL22O00626 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL22O00626 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL22O00626 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL22O00626 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms