Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXLO00592 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXLO00592 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PODXLO00592 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PODXLO00592 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PODXLO00592 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PODXLO00592 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PODXLO00592 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXLO00592 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXLO00592 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXLO00592 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXLO00592 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXLO00592 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXLO00592 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXLO00592 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXLO00592 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXLO00592 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PODXLO00592 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PODXLO00592 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PODXLO00592 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PODXLO00592 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PODXLO00592 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PODXLO00592 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PODXLO00592 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PODXLO00592 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PODXLO00592 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PODXLO00592 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PODXLO00592 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PODXLO00592 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PODXLO00592 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PODXLO00592 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PODXLO00592 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PODXLO00592 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PODXLO00592 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PODXLO00592 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PODXLO00592 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PODXLO00592 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PODXLO00592 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PODXLO00592 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PODXLO00592 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PODXLO00592 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PODXLO00592 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PODXLO00592 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PODXLO00592 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PODXLO00592 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PODXLO00592 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PODXLO00592 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PODXLO00592 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PODXLO00592 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PODXLO00592 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PODXLO00592 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PODXLO00592 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PODXLO00592 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PODXLO00592 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PODXLO00592 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PODXLO00592 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PODXLO00592 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXLO00592 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXLO00592 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXLO00592 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXLO00592 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXLO00592 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PODXLO00592 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXLO00592 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXLO00592 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXLO00592 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXLO00592 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXLO00592 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PODXLO00592 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXLO00592 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXLO00592 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXLO00592 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXLO00592 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PODXLO00592 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PODXLO00592 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PODXLO00592 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PODXLO00592 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PODXLO00592 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PODXLO00592 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PODXLO00592 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PODXLO00592 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXLO00592 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXLO00592 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXLO00592 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXLO00592 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXLO00592 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXLO00592 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PODXLO00592 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXLO00592 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXLO00592 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PODXLO00592 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXLO00592 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXLO00592 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXLO00592 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXLO00592 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXLO00592 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXLO00592 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PODXLO00592 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PODXLO00592 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PODXLO00592 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms