Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TAF4O00268 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF4O00268 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF4O00268 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF4O00268 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF4O00268 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF4O00268 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TAF4O00268 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF4O00268 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF4O00268 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF4O00268 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF4O00268 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF4O00268 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF4O00268 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF4O00268 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF4O00268 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF4O00268 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TAF4O00268 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF4O00268 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF4O00268 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF4O00268 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF4O00268 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF4O00268 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF4O00268 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF4O00268 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF4O00268 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF4O00268 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4O00268 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4O00268 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4O00268 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4O00268 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4O00268 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4O00268 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4O00268 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4O00268 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF4O00268 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4O00268 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4O00268 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4O00268 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4O00268 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF4O00268 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4O00268 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4O00268 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF4O00268 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4O00268 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4O00268 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4O00268 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4O00268 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4O00268 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4O00268 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF4O00268 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF4O00268 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4O00268 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4O00268 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4O00268 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4O00268 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4O00268 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4O00268 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4O00268 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF4O00268 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4O00268 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4O00268 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4O00268 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4O00268 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4O00268 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF4O00268 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4O00268 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4O00268 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4O00268 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4O00268 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF4O00268 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4O00268 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4O00268 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4O00268 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4O00268 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4O00268 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF4O00268 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4O00268 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4O00268 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4O00268 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4O00268 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4O00268 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF4O00268 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4O00268 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4O00268 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4O00268 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4O00268 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4O00268 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAF4O00268 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4O00268 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4O00268 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4O00268 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4O00268 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAF4O00268 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4O00268 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4O00268 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4O00268 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4O00268 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4O00268 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAF4O00268 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms