Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF10AO00220 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFRSF10AO00220 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFRSF10AO00220 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFRSF10AO00220 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms