Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAPO00193 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAPO00193 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAPO00193 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAPO00193 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAPO00193 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMAPO00193 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAPO00193 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAPO00193 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAPO00193 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMAPO00193 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAPO00193 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAPO00193 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAPO00193 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAPO00193 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAPO00193 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMAPO00193 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAPO00193 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAPO00193 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAPO00193 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAPO00193 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAPO00193 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMAPO00193 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAPO00193 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAPO00193 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAPO00193 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAPO00193 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAPO00193 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAPO00193 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAPO00193 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAPO00193 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAPO00193 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMAPO00193 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMAPO00193 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMAPO00193 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMAPO00193 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAPO00193 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAPO00193 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAPO00193 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMAPO00193 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAPO00193 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAPO00193 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAPO00193 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAPO00193 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAPO00193 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAPO00193 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAPO00193 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAPO00193 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAPO00193 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAPO00193 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAPO00193 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAPO00193 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAPO00193 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAPO00193 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAPO00193 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAPO00193 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAPO00193 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAPO00193 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAPO00193 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAPO00193 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAPO00193 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAPO00193 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAPO00193 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAPO00193 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAPO00193 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMAPO00193 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAPO00193 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAPO00193 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAPO00193 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAPO00193 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAPO00193 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAPO00193 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAPO00193 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAPO00193 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAPO00193 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAPO00193 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAPO00193 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAPO00193 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAPO00193 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAPO00193 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAPO00193 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAPO00193 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAPO00193 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAPO00193 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAPO00193 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAPO00193 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAPO00193 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAPO00193 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAPO00193 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAPO00193 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAPO00193 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAPO00193 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAPO00193 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAPO00193 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAPO00193 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAPO00193 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAPO00193 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAPO00193 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAPO00193 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAPO00193 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
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