Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMIM22K7EJ46 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMIM22K7EJ46 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMIM22K7EJ46 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms