Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KT08 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KT08 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KT08 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KT08 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
J3KT08 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KT08 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KT08 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KT08 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KT08 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KT08 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KT08 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KT08 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KT08 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KT08 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KT08 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
J3KT08 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KT08 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KT08 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KT08 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KT08 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KT08 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KT08 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KT08 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KT08 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
J3KT08 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
J3KT08 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3KT08 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3KT08 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3KT08 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3KT08 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3KT08 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3KT08 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3KT08 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3KT08 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
J3KT08 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3KT08 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3KT08 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3KT08 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
J3KT08 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3KT08 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KT08 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KT08 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KT08 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KT08 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KT08 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KT08 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KT08 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KT08 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KT08 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KT08 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KT08 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KT08 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KT08 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3KT08 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KT08 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KT08 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KT08 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KT08 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3KT08 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KT08 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KT08 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KT08 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KT08 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KT08 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KT08 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KT08 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KT08 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3KT08 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KT08 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KT08 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KT08 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KT08 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KT08 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KT08 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KT08 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KT08 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KT08 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KT08 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KT08 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3KT08 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
J3KT08 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KT08 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KT08 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KT08 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3KT08 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms