Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCER2I3L3R5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCER2I3L3R5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCER2I3L3R5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCER2I3L3R5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms