Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CROCC2H7BZ55 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CROCC2H7BZ55 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CROCC2H7BZ55 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CROCC2H7BZ55 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CROCC2H7BZ55 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms