Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BM21 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H3BM21 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BM21 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BM21 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BM21 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BM21 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BM21 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BM21 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H3BM21 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BM21 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BM21 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BM21 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BM21 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BM21 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BM21 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H3BM21 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BM21 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BM21 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BM21 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BM21 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BM21 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H3BM21 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BM21 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BM21 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BM21 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BM21 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BM21 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BM21 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H3BM21 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H3BM21 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H3BM21 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H3BM21 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
H3BM21 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BM21 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BM21 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BM21 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H3BM21 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BM21 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BM21 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BM21 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BM21 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BM21 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BM21 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BM21 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BM21 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BM21 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BM21 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H3BM21 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BM21 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BM21 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BM21 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BM21 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BM21 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BM21 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H3BM21 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BM21 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BM21 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BM21 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BM21 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BM21 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H3BM21 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BM21 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BM21 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BM21 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BM21 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
H3BM21 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BM21 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BM21 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BM21 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H3BM21 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BM21 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BM21 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BM21 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BM21 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
H3BM21 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
H3BM21 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BM21 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BM21 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BM21 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BM21 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BM21 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BM21 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BM21 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BM21 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BM21 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BM21 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BM21 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BM21 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BM21 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BM21 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BM21 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BM21 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BM21 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BM21 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BM21 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BM21 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BM21 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BM21 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BM21 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms