Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PBE3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PBE3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PBE3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PBE3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PBE3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E9PBE3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PBE3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PBE3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PBE3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
E9PBE3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E9PBE3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E9PBE3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E9PBE3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E9PBE3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PBE3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PBE3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PBE3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PBE3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PBE3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PBE3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E9PBE3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PBE3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PBE3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PBE3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PBE3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PBE3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PBE3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PBE3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PBE3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PBE3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PBE3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
E9PBE3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PBE3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PBE3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PBE3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E9PBE3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PBE3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PBE3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PBE3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PBE3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PBE3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PBE3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PBE3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PBE3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E9PBE3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PBE3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PBE3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PBE3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PBE3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PBE3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E9PBE3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PBE3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PBE3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PBE3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PBE3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PBE3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PBE3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PBE3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PBE3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PBE3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
E9PBE3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PBE3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PBE3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PBE3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PBE3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PBE3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PBE3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PBE3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
E9PBE3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PBE3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PBE3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PBE3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PBE3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PBE3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PBE3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PBE3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
E9PBE3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PBE3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PBE3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PBE3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PBE3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PBE3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PBE3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PBE3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PBE3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PBE3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PBE3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PBE3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PBE3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PBE3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PBE3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PBE3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PBE3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PBE3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PBE3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PBE3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PBE3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PBE3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PBE3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms