Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF879B4DU55 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF879B4DU55 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF879B4DU55 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms