Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CENPBD1B2RD01 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPBD1B2RD01 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPBD1B2RD01 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms