Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NOTOA8MTQ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NOTOA8MTQ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NOTOA8MTQ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms