Protein–RNA interactions for Protein: A8MT33

SYCE1L, Synaptonemal complex central element protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1LA8MT33 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCE1LA8MT33 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCE1LA8MT33 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCE1LA8MT33 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCE1LA8MT33 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms