Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KNCNA6PVL3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNCNA6PVL3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KNCNA6PVL3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms